Működési területén biztosítja az egészségügyi alapellátást. Figyelemmel kíséri az egészségügy átalakulásának, átszervezésének jogszabályi változásait és intézményen belül realizálja megvalósítását.
Működési területén kívül biztosítja Szombathely város vonzáskörzetéhez tartozó települések fogorvosi ügyeleti-, és fogászati alapellátását, valamint megoldja, zökkenőmentesen megszervezi a kislaboratórium vér- és egyéb anyagának szállítását a vérszállítási körbe bevont Vas megyei településekről.
Az államháztartásról szóló 2011. évi CXCV. törvény 10.§ (4a) pontjára tekintettel Szombathely Megyei Jogú Város Közgyűlése az 59/2015. (II.26.) Kgy. számú határozatával 2015. április 1-től a Szombathelyi Egészségügyi Alapellátó Intézet tevékenysége, feladatellátása kiegészítésével létrehozta a Szombathelyi Egészségügyi és Kulturális Intézmények Gazdasági Ellátó Szervezetét.
A Szombathelyi Egészségügyi és Kulturális Intézmények Gazdasági Ellátó Szervezete gyógyító-megelőző egészségügyi alapellátási feladatain túl – melyek pénzügyi-számviteli, gazdaság, műszaki-informatikai, munkaügyi és humánpolitikai, anyag és eszközgazdálkodási feladatai ellátása – biztosítja a Szombathely Megyei Jogú Város Közgyűlése által jóváhagyott munkamegosztási és felelősségvállalási megállapodásban meghatározottak szerint
az államháztartásról szóló törvény végrehajtásáról rendelkező 368/2011. (XII.31.) Kormány rendelet 9§ (1) bekezdése (a) pontjában meghatározott pénzügyi, gazdasági, adminisztrációs feladatait.
Az Intézmény feladatait 44 telephelyen látja el, melyből 9 rendelő épületegyüttese és az Egészségfejlesztési Iroda tartozik az intézeti kezelésbe, a többi telephelyünk közös használatú épületegyüttesben található meg.
A háziorvosi rendelések adminisztrációs terheinek csökkentése és a betegre jutó tényleges gyógyítási idő megnövelése érdekében betegirányítási rendszer került kialakításra a Váci Mihály utcai felnőtt háziorvosi, majd a Szűrcsapó utcai felnőtt és a Kiskar utcai felnőtt és gyermek rendelőkben.
Az Intézmény ellátja a Kábítószer Egyeztető Fórum működésével kapcsolatos, valamint az Egészséges Városok Szövetsége tagságból adódó feladatok pénzügyi, gazdasági, elszámolási feladatait.
A minden évben megrendezésre kerülő „Anyatej Világnapja” rendezvény védnöke a Szombathelyi Egészségügyi és Kulturális Intézmények Gazdasági Ellátó Szervezete igazgatója.